肠道病毒71型甘肃分离株VP1基因特征分析

摘要：

目的 分析肠道病毒71型(Enterovirus,EV71)甘肃分离株VP1基因的特征.方法 应用RT-PCR法扩增4株EV71甘肃分离株(46F、47F、51F和55F)的VP1基因,克隆人pTA2载体,进行核苷酸序列测定,并进行序列的同源性比较及进化树分析.结果 4株病毒VP1核苷酸序列长度均为891 bp,推导的氨基酸序列含297个氨基酸.51F与55F毒株核苷酸和氨基酸同源性均为100%,46F与47F的同源性分别为99.6%和99.0%,4株病毒与EV71的C4亚型毒株核苷酸同源性在96%以上,氨基酸同源性在99%以上.同源性和进化树分析显示,4株分离株分属2个群,其中51F和55F毒株同属一个群,其与昆明分离株kunming41-08亲缘关系最为相近;46F和47F同属一个群,其与内蒙分离株0723F/NM/CHN/07关系最为相近.结论 4株EV71甘肃分离株属于C4亚型,为中国EV71的基因分型、分子流行病学研究提供了参考.

关键词：肠道病毒71型、VP1基因、基因特征

所属期刊栏目：23

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：甘肃省科技重大专项计划课题092GKDA010

在线出版日期：2010-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1046-1049