人3型副流感病毒兰州分离株LZ22全基因组序列的测定及分析

摘要：

目的 对人3型副流感病毒(HPIV-3)兰州分离株LZ22进行全基因组序列测定并分析.方法 通过引物步移法和RACE技术测定LZ22株的全基因组核苷酸序列,并分析其基因组结构特点和进化地位.结果 LZ22株的基因组全长15 462个核苷酸,符合副黏病毒科基因组"6碱基原则",按照3'-NP-PP/C-M-F-HN-L-5'的顺序编码6种结构蛋白,基因结构与已知序列HPIV-3分离株相同.与GenBank登录的4株HPIV-3参考株进行同源性比对发现,LZ22株与ZHYMgz01株(中国广州)的同源性最高,为99.0%(147个核苷酸变异),与14702株(加拿大)的同源性最低,为94.6%(832个核苷酸变异).系统进化分析表明,LZ22株与ZHYMgz01株为同一进化分支,与GP株(日本)进化关系次之,与14702株和JS株(美国)进化关系最远.结论 LZ22株病毒基因组具有副黏病毒的遗传特征,核苷酸序列与HPIV-3有高度的同源性.HPIV-3的系统进化可能与地域相关.

关键词：人3型副流感病毒、LZ22株、全基因组序列、同源性、系统进化分析

所属期刊栏目：23

分类号：Q789;R373.1~+3(基因工程（遗传工程）)

在线出版日期：2010-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：230-233,242