基于RNA-Seq技术分析江西豆豉对肠上皮细胞基因差异表达的影响

摘要：

目的:基于RNA-Seq研究江西传统特色豆豉与肠上皮细胞的相互作用.方法:Caco-2细胞与豆豉水提样共孵育后,采用RNA-Seq筛选差异表达基因,进行KEGG、GO和PPI网络分析.结果:筛选差异表达基因17 892个,其中显著性240个,含上调表达125个、下调表达115个.KEGG功能注释215个信号通路,主要富集在新陈代谢、免疫系统、细胞调控、细胞粘附等类别.GO分析主要涉及免疫应答、细胞结构及功能调控、营养素代谢、神经传导及激素分泌调节等生物学过程.PPI网络分析在STRING数据库内有效注释的204个基因编码的蛋白互作,其中IL8、VCL、NFKBIA等节点度较高.结论:江西传统特色豆豉可引起肠上皮细胞多类基因差异表达,为阐明豆豉对肠道健康作用的分子机制提供科学依据.

关键词：豆豉、肠上皮细胞、RNA-Seq、基因差异表达

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资助基金：国家自然基金地区项目;福建省卫生健康中青年骨干人才培养项目;福建省中青年教师教育科研项目;海洋生物医药资源福建省高校工程研究中心厦门医学院开放课题;天然化妆品福建省高校工程研究中心厦门医学院开放课题;厦门医学院自然科学研究项目

在线出版日期：2020-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：23-29