基于网络成分分析的阿尔茨海默症靶基因动态表达研究

摘要：

解析转录因子与靶基因之间相互调节的关系并构建转录调控网络,对研究阿尔茨海默症(AD)的致病机理、早期诊断及制药等具有重要意义.网络成分分析(NCA)是一种能够动态预测转录因子活性并表现其影响关系的方法.本研究利用转录因子对靶基因的调控作用,及基因在AD不同病程中表达的先验知识和生物数据,通过预处理AD基因表达数据,选择出10个转录因子和85个靶基因进行网络成分分析,并利用162条调控关系构建AD基因调控网络,形成和展示了转录因子对靶基因的动态调控关系和作用.通过动态预测转录因子活性及构建网络图,发现转录因子在AD疾病的不同程度的活性有明显变化趋势,其调控的靶基因变化符合AD的病理特征.如靶基因NONO在转录因子ANAPC5的调控下,表达值由3 126上升至4 508,而靶基因YWHAZ表达值由6 000下降到接近于0.该研究为AD致病机理探寻、早期诊断和相应的分子生物学实验,提供了新的思路和依据.

关键词：阿尔茨海默症、网络成分分析、转录因子、动态网络结构

所属期刊栏目：32

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金61271446;上海市科委青年科技启明星计划A类11QA1402900;上海市教委科研创新项目11YZ141

在线出版日期：2014-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：418-425