致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建

摘要：

为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库.本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fisher's精确检验R程序包对Gene Ontology和Pathway的注释结果进行富集效应分析,并调用Graphviz工具对蛋白质相互作用结果进行图形化描述.致病疟原虫分子功能注释二级数据库提供多入口的分子注释类型,使Gene Ontology、Pathway及蛋白质相互作用注释信息以图形化界面直观显示.该数据库为疟原虫致病分子机制研究提供良好的高通量数据分析工具,可有效促进疟原虫基因功能、信号通路及疟疾疫苗抗原筛选等方面的研究.

关键词：疟原虫、功能注释、二级数据库

所属期刊栏目：31

分类号：R318(医用一般科学)

资助基金：科技部国家科技基础条件平台科学数据共享工程重大项目基础医学科学数据中心2005DKA32402

在线出版日期：2013-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：882-888