C '散点图:一种描述氨基酸结构差异的新方法

摘要：

研究氨基酸结构对蛋白质结构预测具有重要意义.目前主要采用二面角来描述氨基酸的几何结构,但是角度的方法比较抽象,并且难量化地评估结构差异的程度.提出一种描述氨基酸结构差异的新方法——C'散点图.这种方法用散点图的形式在三维坐标图上显示羧基碳原子C'的相对坐标,以描述氨基酸结构的多样性,比目前广泛使用的二面角方法更加直观,在分析多肽片段中氨基酸结构多样性方面具有较高的可视性和便利性.同时通过计算散点图上原子间的最远距离,该方法可望使量化衡量氨基酸结构差异性成为可能.C'散点图对进一步深化氨基酸结构分析具有重要意义.

关键词：氨基酸几何结构、C’散点图、二面角

分类号：R318.04(医用一般科学)

资助基金：徐州医学院院长人才基金09KJ211

在线出版日期：2011-12-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：685-689