基于内插马尔可夫模型的Gibbs改进算法识别调控元件

摘要：

不同阶数插值形式的马尔可夫内插模型,可以表示在一个DNA序列中相邻核苷酸之间的前后关系的变化.本研究将内插马尔可夫模型引入Gibbs采样算法,识别基因上游序列中的调控元件.对模拟序列和10组来源于文献的酵母基因序列的测试结果表明,改进后的算法在识别保守性差的调控元件和抗噪声能力方面均优于传统的Gibbs采样算法.

关键词：内插马尔可夫模型、Gibbs采样、调控元件、基因序列

所属期刊栏目：25

分类号：Q612(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金60121101;国家高技术研究发展计划863计划2002AA231071;江苏省自然科学基金BK2002057

在线出版日期：2006-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：396-399,410