乾华肉用美利奴羊次级毛囊小RNA文库构建及miR-1-3p靶基因预测

摘要：

本试验旨在构建乾华肉用美利奴羊次级毛囊不同发育时期的小RNA文库和预测筛选miRNA的候选靶基因.通过高通量测序技术构建乾华肉用美利奴羊次级毛囊小RNA文库;采用荧光定量PCR对高通量测序结果进行验证;利用miRDeep2软件对miRNA(长度为20～24 nt的小RNA)进行鉴定;利用Targetscan v7.0、RNA22 v2.0和MiRanda三个在线靶基因预测软件对miR-1-3p的靶基因进行预测分析.成功获得乾华肉用美利奴羊次级毛囊生长期、退行期、休止期小RNA纯净reads分别为10279515、11712215和10926258.分别基于荧光定量与高通量测序的5个miRNA的相对表达量结果趋势基本一致.从次级毛囊生长期、退行期和休止期分别鉴定获得miRNA 1250、1304个和1266个.确定成纤维细胞生长因子14(FGF14)和类胰岛素生长因子Ⅰ受体(IGF1R)为miR-1-3p的候选靶基因.研究结果为后续靶基因验证及确定调控乾华肉用美利奴羊毛囊周期性发育的候选基因奠定基础.

关键词：乾华肉用美利奴羊、小RNA文库、miR-1-3p、靶基因预测

分类号：Q81(生物工程学(生物技术))

资助基金：吉林省教育厅科学技术研究项目;吉林医药学院博士科研启动基金项目;吉林医药学院博士科研启动基金项目;吉林省科技发展计划项目

在线出版日期：2023-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：35-39