屎肠球菌自溶的基因表达差异分析

摘要：

为探讨屎肠球菌自溶状态下基因表达变化,利用高通量测序技术进行RNA-Seq分析.差异基因分析显示,自溶状态下共有783个基因表达出现差异,其中在自溶状态下上调和下调的基因分别为689和94个.GO功能聚类分析显示,差异基因主要富集在细胞、细胞组分、生物合成、有机物质生物合成几个方面.KEGG富集分析发现,差异基因主要参与了核糖体、氨基酰基-tRNA生物合成、嘌呤代谢、肽聚糖生物合成、嘧啶代谢、同源重组、氨基酸合成等通路,且下调的差异基因主要富集在碳代谢、糖酵解/糖异生、丙酮酸代谢等能量代谢相关通路.说明屎肠球菌自溶状态下代谢出现了明显改变,对碳源的利用不足和合成能力的下降可能是导致屎肠球菌自溶发生的重要原因.通过分析屎肠球菌自溶状态下基因的表达情况,得到了充分的基因数据,为进一步研究屎肠球菌的自溶发生机制提供了基础.

关键词：屎肠球菌、自溶、转录组、差异表达基因、GO功能

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：江西省科学院科研开发专项基金博士项目;国家自然科学基金;江西省重点研发计划;江西省重点研发计划;江西省科学院重点科研开发项目;江西省科学院省级科技计划项目

在线出版日期：2023-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：32-39