基于SNP芯片撒坝猪保种群体的遗传结构分析

摘要：

试验旨在从分子水平分析撒坝猪保种群体的遗传结构变化以及遗传多样性,拓宽遗传背景,指导和促进撒坝猪的保种工作.利用"京芯一号"SNP芯片对云南省楚雄州种猪场100头保种撒坝猪群体的DNA进行遗传群体结构分析.结果表明:撒坝猪保种群体的有效群体含量(Ne)为21,群体的多态性标记比例(PN)为0.533,群体的期望杂合度(He)为0.263,观察杂合度(Ho)为0.275;G矩阵表明公畜与母畜之间基因组亲缘关系呈中等;100头撒坝猪保种群体可分为A～G 7个家系;在100头撒坝猪保种群体中,共检测到3552个长纯合片段(ROH),长度在8.20～621.32 Mb,每头撒坝猪含有2～53个ROH,且平均个体ROH长度为(319.38±111.39)Mb.该撒坝猪保种群体基于ROH的近交系数(FROH)平均为0.130,中位数大于0.125.本研究表明,该保种撒坝猪群体内家系数量适中,个别家系公畜数量较少,各家系个体数差异明显,群体中可能存在非撒坝猪的外来血缘,个体亲缘关系呈中等程度,近交程度较高,需要进行合理选配或者从原种场引入新的血统方式来确保撒坝猪遗传资源的多样性.

关键词：撒坝猪、保种群体、遗传多样性、SNP芯片、亲缘关系、家系结构

分类号：S813(普通畜牧学)

资助基金：云南省地方畜禽遗传资源背景分析工作

在线出版日期：2022-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：7-11