10.15906/j.cnki.cn11-2975/s.20220307
多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用
本文通过16S rRNA基因和多位点序列分型(MLST)技术,对凝结芽孢杆菌不同菌株进行亲缘关系分析.试验选取国内具有代表性的15株凝结芽孢杆菌菌株,菌株纯化后提取基因组DNA,采用传统的16S rRNA基因分子鉴定和MLST技术相结合进行分析.其中MLST采用5个管家基因:adk、recF、sucC、rpoB和spoOA,结合参考凝结芽孢杆菌菌株DSM1的已知管家基因序列,用CE Design V1.04软件设计引物进行PCR扩增,测序结果剪接、串联后,做系统进化树分析.结果 显示:16S rRNA基因显示所有菌株的基因序列相似性在99%以上,无法区分菌株间的差异性.而MLST结果显示,国内大部分凝结芽孢杆菌菌株G1-G9、E21和Y1、Y2为第一类别(Bootstrap值≥99),Y3、Y4、Y5三个菌株为第二类别(Bootstrap值≥99),参考菌株DSM1和国内凝结芽孢杆菌菌株差异较大为第三类别.
凝结芽孢杆菌;多位点序列分型(MLST);管家基因;亲缘关系
S816.7(普通畜牧学)
2022-03-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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