10.3969/j.issn.1001-7216.2014.01.005
干旱驯化后节水抗旱稻苗期不同发育时间DNA甲基化模式变化分析
以一个节水抗旱稻沪旱3号为研究材料,经过连续6代干旱胁迫驯化后,采用甲基化敏感扩增多态性方法在苗期不同发育时间对原始代(G0)和第6代(G6)DNA甲基化变化情况进行分析.结果表明,沪旱3号甲基化位点比例约为34%,其中,全甲基化位点约占84%,半甲基化位点约占16%.在苗期,随着沪旱3号生长发育,甲基化水平下降.不同世代或/和不同发育时间差异甲基化位点占总检测位点的4.0%,其中,大部分仅与发育相关(57.9%),而世代之间无差异.干旱驯化后, G6的DNA甲基化模式发生了改变.G6与G0相比,在3叶期,去甲基化事件占主要部分(59.1%);在4叶期,甲基化事件占主要部分(47.9%).生长发育涉及全基因组DNA甲基化变化,变化位点主要分布在启动子区域和外显子区域.功能聚类分析表明差异甲基化位点相关基因涉及广泛的功能.
干旱驯化、节水抗旱稻、DNA甲基化、甲基化敏感扩增多态性
Q945..78;S511..01(植物学)
国家863计划资助项目2012AA101102;上海市科技兴农重点攻关项目沪农科攻字2010第1-1号;高层次科技人才培引工程2010C1120
2014-01-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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