水稻CYP81A6基因干扰对其他基因表达的影响

摘要：

为了明确抑制基因CYP81A6的表达对水稻的自身功能基因表达的影响,对亲本水稻秀水110和转基因水稻450-3的mRNA进行深度测序,并将获得的序列信息通过水稻基因数据库和生物信息学手段进行注释和功能基因比较.结果表明,在3529个差异表达的基因中,上调表达基因1018个,下调表达基因2511个;秀水110与450-3中共同表达的基因有2533个,仅在450-3中表达的基因有363个,仅在秀水110表达的基因有633个.与水稻基因数据库功能已知的296个抗性基因对比,发现450-3中差异表达的基因有64个功能已知且与水稻抗性相关,包括2个抗虫相关基因,17个抗病相关基因和45个抗逆相关基因,预示着基因CYP81A6的抑制表达对水稻抗性会产生一定的影响.GO功能和通路显著性富集分析显示,差异表达基因显著富集在38个GO条目和13个通路上,在结合能力(GO:0020037)和光合作用(KO 00195)通路上富集最为显著.通过对转基因水稻的转录组分析,阐明转基因水稻基因与亲本相比发生的变化,进而分析这些变化对转基因水稻产生的影响,从基因生态学角度为转基因水稻的安全性评价提供科学依据,可作为一种新的方法应用于转基因生物的安全性评价.

关键词：转基因水稻、CYP81A6、高通量测序、差异表达基因、抗性基因

所属期刊栏目：27

分类号：Q785;S511.032(基因工程（遗传工程）)

资助基金：浙江省自然科学基金重点资助项目Z3080241

在线出版日期：2014-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：447-456