利用SSR分子标记分析云南陆稻品种遗传多样性

摘要：

利用24对SSR引物对云南131个陆稻品种进行遗传多样性分析.共检测到195个等位基因.每个位点的等位基因数平均为8.125个,范围在5(RM55)～13(RM218、RM241)之间；平均表观杂合度为0.0014,平均期望杂合度为0.6545；平均Shannon-Weaver指数(I)为1.381;Nei基因多样性指数(H)平均为0.6543,变幅为0.2073(RM235)～0.8689(RM218).不同地区间陆稻种质资源遗传多样性比较分析表明,滇西南和滇南地区存在丰富的遗传变异,是云南陆稻品种遗传多样性的分布中心.藏缅语族和孟-高棉语族所种植的陆稻品种遗传多样性最丰富.AMOVA分析表明陆稻的遗传变异主要存在于地区内品种间(82％),只有3％遗传变异存在于地区间,品种内的遗传变异占15％.聚类分析显示Nei遗传相似系数为0.22时,云南陆稻品种分为籼粳两个类群,主坐标分析与UPGMA聚类结果基本吻合,并将类群Ⅳ的4个偏籼品种从粳稻类群中重新划归到籼稻类群中,校正了UPGMA聚类的误差,但是不能区分地理组.

关键词：陆稻、遗传多样性、简单重复序列、主坐标分析

所属期刊栏目：26

分类号：S511.019;S511.6(禾谷类作物)

资助基金：国家973计划资助项目2006CB100205;云南省水稻产业技术体系资助项目A3006517

在线出版日期：2012-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：155-164