水稻microRNA单核苷酸多态性

摘要：

microRNA(miRNA)是一类内源性非编码小RNA,长度约22个核苷酸.miRNA通过与靶基因rnRNA特定位点结合,调控植物生长、发育和胁迫耐受性.pre-miRNA的单核苷酸突变会影响miRNA的成熟过程和调控功能,因此,研究miRNA基因中的单核苷酸多态性(SNP)分布对研究miRNA功能分化和基因进化有重要意义.为探讨水稻miRNA基因单核苷酸多态性及其潜在生物学意义,基于现有水稻SNP数据,分析f水稻pre-miRNA区、侧冀区(位于pre-miRNA上下游,与pre-miRNA等长的区间)的SNP分布.与已经报道过的绝大多数生物不同,SNP在水稻pre-miRNA区的频率与侧翼区无显著差异.进一步研究SNP在pre-miRNA二级结构中的分布,发现种子区SNP频率跟茎区、环区也无显著差异.然而,SNP在水稻基因区分布跟其他生物相似,即基因区SNP频率显著低于基因侧翼区.这可能暗示pre-miRNA侧翼区功能对miRNA非常重要,也可能与SNP在不同miRNA基因之间的分布不均衡有关,一部分miRNA基因正经历纯化选择压力放松,积累较多突变而成为新的基因或失去功能.但是以上结果并不排除是由于当前水稻SNP数据可靠性不高而导致的偏差.

关键词：microRNA、水稻、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：25

分类号：Q74;S511(生物小分子的结构和功能)

资助基金：浙江师范大学博士科研启动基金ZC304009154

在线出版日期：2012-01-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：467-474