中国对虾4代人工选育群体与1个野生群体遗传多样性分析及差异SNP位点筛查

摘要：

利用2b-RAD技术对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis) 2015年、2016年、2017年、2019年4代选育群体和野生群体合计821尾个体进行简化基因组测序,分析中国对虾人工选育群体和野生群体遗传多样性特征,挖掘在持续人工选育过程中受选择的SNP位点.测序共得到83767个SNP位点,F-统计结果显示,野生群体与选育群体间遗传分化系数(FsT)均值为0.022,野生群体与2019年选育群体之间遗传分化程度最高为0.0260,与2015年选育群体之间遗传分化程度最低为0.0190;野生群体与选育群体之间遗传分化系数(FST)均小于0.05,为弱遗传分化.群体主成分分析(PCA)结果显示野生群体与选育群体之间遗传结构未发生明显改变.遗传多样性统计结果表明,野生群体与选育群体期望杂合度(He)均值分别为0.1716和0.1806,观测杂合度(Ho)均值分别为0.1861和0.1943,多态性信息含量(PIC)均值分别为0.1428和0.1515,核苷酸多态性(Pi)均值分别为0.1732和0.1813,其中2017年、2019年选育群体各遗传多样性指数与野生群体相比均存在显著差异(P＜0.05).对不同世代选育群体与野生群体进行选择消除分析,分别得到92个、103个、166个、117个受选择SNP位点,共有位点数目为4个.相邻世代选育群体之间等位基因频率逐代上升的共有位点数目为7107个,其中3674个位点显著偏离哈迪-温伯格平衡(P＜0.05);等位基因频率逐代下降的共有位点数目为8501个,其中4101个位点显著偏离哈迪-温伯格平衡(P＜0.05).研究结果表明,中国对虾经过累代人工选育,依然具有较高的遗传选育潜力,可以继续作为人工选育材料.

关键词：中国对虾;2b-RAD;SNP标记;遗传多样性;人工选择

所属期刊栏目：28

分类号：S961(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;中国水产科学研究院创新团队项目

在线出版日期：2022-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1505-1514