磁珠富集法与小片段克隆法筛选鲤微卫星的比较研究

摘要：

用2种方法克隆黑龙江鲤(Cyprinus (Cyprinus) carpio haematopterus)的微卫星序列.这2种方法分别是:①经典的小片段DNA克隆库,用末端标记的[γ-32] ATP的CA重复序列为探针筛选;②将酶切获得的小片段DNA用结合有磁珠的并连接有15个CA重复序列的生物素进行富集,获得的含有CA重复的DNA片段并经过两次PCR扩增再克隆的方法获得富集微卫星片段的克隆库.从前一个方法的克隆库中筛选2000个菌落,获得阳性克隆45个,有22个含有微卫星,完美型的占63.6%,非完美型的占22.7%,混合型的占13.7%,重复次数超过10的有9个,占40.9%;从方法②的克隆库中筛选2600个菌落,获得阳性克隆1300个,测序其中的390个克隆,微卫星314个,完美型的占79.0%;非完美型的占14.3%;混合型的占6.7%,重复次数超过10的有293个,占93.3%.结果表明,用生物素结合磁珠富集法克隆微卫星效率高,成本低,所获微卫星质量高,是一种值得推荐的微卫星制备方法.

关键词：磁珠富集、小片段克隆、鲤、微卫星

所属期刊栏目：12

分类号：Q959.468(动物学)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划863-101-05-02-01

在线出版日期：2005-03-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：126-132