基于转录组测序的山药NBS-LRR家族基因鉴定和分析

摘要：

为了探究NBS-LRR类抗病基因在铁棍山药响应不同真菌侵染中的作用,通过同源克隆从山药基因组中扩增出NBS类基因DoRGA2和DoRGA4,RT-qPCR分析发现山药黑斑病病原真菌互隔交链孢和内生真菌耐盐青霉侵染会不同程度诱导DoRGA2和DoRGA4上调表达.同时,利用转录组测序分析互隔交链孢和耐盐青霉侵染山药愈伤组织后的NBS-LRR家族基因,结果共鉴定到47个山药NBS-LRR家族基因,包括N、NL、CN、CNL和TN5种类型,分别有25、15、3、3、1个基因;不同亚家族NBS-LRR蛋白的进化路径存在差异,且这些NBS-LRR类蛋白以酸性为主,普遍具有亲水性,主要定位在细胞膜或细胞质.这些 NBS-LRR 家族基因中,TRINITY_DN9146_c0_g1、TRINITY_DN8009_c1_g1、TRINITY_DN49830_c0_g1和TRINITY_DN39475_c0_g1在接种互隔交链孢后显著上调表达,而TRINITY_DN18700_c0_g3在接种耐盐青霉菌后显著上调.

关键词：山药、NBS-LRR基因、互隔交链孢、黑斑病、RNA-seq

分类号：TN948.2;S435.121;S511.01

资助基金：现代农业产业技术体系;国家重点研发计划;河南省高等学校重点科研项目;中原英才计划-科技创新领军人才项目

在线出版日期：2024-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：47-57