参与番茄叶形发育的TCP转录因子的表达及生物信息分析

摘要：

TCP是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育过程中起着重要作用.本试验选取18个在番茄叶片组织中高表达的TCP转录因子,检测其在叶片不同发育时期的表达水平,筛选出与叶片发育进程相关的SlTCP2、SlTCP4、SlTCP8、SlTCP11、SlTCP14、SlTCP15、SlTCP19、SlTCP22、SlTCP24、SlTCP25等10个TCP家族成员.对其进行生物信息分析,结果表明这10个SlTCP成员分布在8条不同的染色体上,它们的碱基、氨基酸长度以及分子量大小相差较大,均为不稳定的亲水性蛋白;SlTCPs的蛋白结构和成分分析表明,中间约50 aa长度的氨基酸序列保守性相对较高且丝氨酸占比较多;SlTCPs蛋白的亚细胞定位预测均在细胞核上.以上SlTCPs蛋白均含有TCP家族典型的保守域,其保守基序的分类与系统进化树的分支一致.组织表达分析结果表明,SlTCP11、SlTCP15、SlTCP24在番茄叶片发育各个时期的不同组织器官中,均有相对较高的表达水平.对番茄典型叶形突变体LA2922、LA2532及其对应的野生型进行qRT-PCR,结果表明SlTCP2、SlTCP11、SlTCP14、SlTCP15、SlTCP19、SlTCP24在LA2922和LA2532叶片中的表达水平呈相反趋势.结合生物信息分析结果,明确了SlTCP2、SlTCP11、SlTCP14、SlTCP15、SlTCP19、SlTCP24可能在番茄叶形发育中起关键作用,为进一步探究番茄叶片生长发育的分子机制奠定了基础.

关键词：番茄;TCP转录因子;叶形发育;生物信息学;实时定量PCR

资助基金：国家重点研发计划项目;国家自然科学基金青年科学基金项目

在线出版日期：2021-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：45-56