2017-2019年济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行病学和基因组学分析

摘要：

目的 了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征.方法 采集2017-2019 年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据库进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、疫苗抗原分析,利用IQ-TREE和Splits Tree构建系统发育树.结果 2 017-2 019 年共检测1 086 份健康人群咽拭子标本,分离出21 株脑膜炎奈瑟菌,健康人群平均带菌率为1.93％.其中流行前期带菌率为0.93％,流行期带菌率为2.30％,流行后期带菌率为1.83％.17～19 岁人群带菌率较高,3～5 岁儿童及≥20 岁成人中未检出阳性菌株.检出的21 株菌株中,B群15 株,C 群1 株,不可分群5株.通过基因组分析,主要的ST 型为ST-12 301 和ST-14 65 5,ST-17 464、ST-17 46 5、ST-17 466、ST-17 467 和ST-17468 为本研究新发现的ST型.进行基因测序的19 株菌株中,有8 株属于4821 克隆群,其余菌株不属于确定的克隆群,有3 株血清型为不可分群的菌株但其基因型为B型.结论 济宁市2017-2019 年健康人群中脑膜炎奈瑟菌血清群以B群为主.本研究新发现5 种MLST序列型,提示近几年菌株基因组存在微进化.MLST序列型的变迁有可能导致流行模式发生改变,有必要开展持续监测.17～20 岁人群带菌率高,应密切关注菌株在人群中的扩散传播,以防引起流脑病例.

关键词：脑膜炎奈瑟菌、健康人群、血清群、核心基因组多位点序列分型、系统发育树、4821克隆群

所属期刊栏目：39

分类号：R378.1+5(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2023-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：879-886