2006-2016年贵州省炭疽芽胞杆菌SNR分型分析

摘要：

目的 对贵州省2006-2016年分离的炭疽芽胞杆菌进行单核苷酸重复序列分型分析(SNR),了解菌株SNR型别特征,为炭疽疫情监测、调查与溯源提供技术手段和科学依据.方法 提取贵州省2006-2016年间不同地区的炭疽芽胞杆菌菌株基因组DNA,应用SNR各位点引物进行PCR扩增,将扩增产物进行毛细管电泳分析获得各位点序列长度.运用Bionumerics 7.6软件将扩增长度片段信息进行聚类分析获得各菌株SNR型别并构建最小间距图.结果 来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌被分为37个SNR型;聚类分析显示,71株菌株被分为A和B两群,其中A群共有27个分支,又可分为A1和A2两个亚群;B群共有10个分支,可分为B1和B2两个亚群.最小间距图显示,71株菌株被分别为7个SNR克隆群(complex)和5个单一的SNR型(singleton).结论 来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌共分为37个SNR型,SNR型别具有多样性;SNR分子分型方法对炭疽芽胞杆菌分型具有高分辨率的特点,SNR型别分布与菌株的时间和地域分布具有一定相关性.

关键词：炭疽、炭疽芽胞杆菌、单核苷酸重复序列分析、聚类分析

所属期刊栏目：37

分类号：R378.7(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：贵州省科技创新人才团队项目[No.20185606;贵州省高层次创新型人才培养项目[No.20164021号;贵州省卫生计生委科学基金项目

在线出版日期：2021-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：230-235