福建省首例狂犬病街毒分离株基因组序列测定及分析

摘要：

目的 对福建省首次分离的狂犬病毒街毒株进行全基因组序列测定分析,了解病毒序列及进化特征,为进一步研究街毒的遗传变异规律积累理论资料.方法 从病毒细胞培养液中直接提取病毒RNA,采取分段RT-PCR的方法进行序列扩增,将获得的各基因片段进行分子克隆后测序,运用生物学软件进行拼接得到全基因组序列,并进行分析.结果 应用自行设计的引物,获得了狂犬病毒街毒株的全基因组核苷酸序列,编码区没有插入和缺失的发生,对毒株在N蛋白主要抗原位点发生的突变为在B细胞表位发生了379位V→L的突变;糖蛋白抗原位点Ⅰ(231位)的氨基酸为L;在抗原位点Ⅱ 199位点发生了R→G的突变,抗原位点Ⅲ 333位为精氨酸(R).与国内河北一街毒株BD06无论在G基因的进化上还是N基因的分型上都有着很近的亲缘关系.结论 获得狂犬病毒株全基因组序列,了解病毒重要的氨基酸位点特征,为进一步探讨福建省狂犬病毒变异、传播机制等奠定基础.

关键词：狂犬病毒、基因组、序列分析

所属期刊栏目：31

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：福建省自然科学基金2012J05133;grants from the Fujian Natural Science Foundation2012J05133

在线出版日期：2015-06-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：311-314,329