浙江省甲型H1N1流感病毒血凝素基因序列分析

摘要：

目的 分析浙江省2009-2011年甲型H1N1流感病毒血凝素基因(HA)序列进化特征.方法 提取浙江省2009-2011年8株甲型H1N1流感病毒基因组RNA,RT-PCR扩增血凝素基因,测序并拼接出ORF;从GenBank数据库下载2009-2012年国内外甲型H1N1流感病毒HA 基因序列,选择20株作为代表进行分析.采用MEGA软件对其进行种系发生树的构建.结果 扩增并测序获得8株甲型H1N1流感病毒1 701 bp的HA基因ORF,与国内外甲型H1N1流感病毒HA序列比对后发现所有序列的同源性均较高,2009年和2010年浙江省3株病毒HA与北美早期毒株A/California/04/2009(H1N1)同源性达到99.4%～99.5%,2011年浙江省5株病毒HA与A/California/04/2009(H1N1)同源性为98.5%～99.1%.在1株来自重症患者的毒株中发现了D222G突变.结论 与早期毒株相比,虽然浙江省2011年的甲型H1N1流感病毒血凝素基因累积了更多的变异,但所有毒株的同源性达到98.5%以上.血凝素中D222G突变可能与重症甲型H1N1流感病毒感染相关.

关键词：甲型H1Nl流感病毒、血凝素、序列分析、种系发生树

所属期刊栏目：29

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：浙江省自然科学基金Y207819;浙江省医药卫生科学研究基金2010KYB031

在线出版日期：2013-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：566-569