微小隐孢子虫含EF-hand结构域蛋白家族的生物信息学研究

摘要：

目的 对微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum,Cp)含EF-hand结构域家族蛋白进行生物信息学研究,探讨该家族蛋白的EF-hand结构域与Ca2+信号的关系以预测该家族蛋白的功能,为隐孢子虫病的诊断和治疗提供新的方向.方法 首先通过数据收集,获得EF-hand结构域家族蛋白的序列信息,接着对每个蛋白进行CDD结构域搜索和NCBI BLAST 的比对分析,确证为EF-hand结构域家族蛋白,最后进行结构域分析和功能预测.结果 搜索到了C.parvum Iowa Ⅱ中18个含有EF-hand结构域的蛋白,它们之间的氨基酸长度,分子量大小以及等电点等都有很大的区别,通过结构域分析把EF-hand家族分成了含一个EF-hand结构域、二个EF-hand结构域、同时含EF-hand和STKc-AGC两种结构域和同时含EF-hand和PKC两种结构域四大类.结论 EF-hand结构域蛋白家族与重要的钙离子信号作用有着密切的关系,而C.parvum对宿主细胞的侵袭能力与胞内的Ca2+水平密切相关,所以EF-hand蛋白家族很有可能成为隐孢子虫病治疗的一个新的突破点.

关键词：微小隐孢子虫、EF-hand结构域、Ca2+、生物信息学分析、功能预测

所属期刊栏目：28

分类号：R382.3(医学寄生虫学)

资助基金：国家自然科学基金30901249,81101267;广东省自然科学基金I0151063201000036,S2011010002526;广东省医学科研基金B2007097

在线出版日期：2012-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：653-658,663