2株乙型脑炎病毒的E基因的克隆与序列分析

摘要：

目的 对2009年分离自四川省崇州与内江地区的2株乙型脑炎病毒的E基因进行序列测定与分析,了解其序列特征与遗传变异情况.方法 采集猪场流产死胎脑组织与蚊虫样品12份,用BHK-21细胞分离培养出2株乙型脑炎病毒,命名为JEV-CZ1株和JEV-NJ1株.针对乙脑疫苗株SA14-14-2基因组252-2509区段设计1对引物,扩增出分离株主要抗原基因E基因并测序,与不同国家及地区的乙脑毒株进行E基因核酸序列及推导氨基酸序列的同源性比较与进化树分析.结果 测序分析的E蛋白基因片段长1 500 bp,编码500个氨基端残基.JEV-CZ1株与广泛使用的减毒疫苗株SA14-14-2的E基因核酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为87.6%和97.2%,JEV-NJ1株与SA14-14-2株的E基因核酸与氨基酸序列的同源性分别为99.5%与99.2%.JEV-CZ1株与疫苗株SA14-14-2株在E蛋白3个结构域中有15个氨基酸的差异,JEV-NJ1株有3处差异.其中JEV-CZ1株在E138位的氨基酸为Glu,符合强毒特征.通过基因遗传进化分型显示,JEV-CZ1株为基因Ⅰ型,JEV-NJ1株为基因Ⅲ型,且2株病毒与以往四川分离的毒株遗传关系较近.结论 此次研究的分离株具有较强的地域性,遗传变异不大,且与疫苗株有较高的同源性.

关键词：乙型脑炎病毒、E基因、氨基酸序列、遗传进化分析

所属期刊栏目：28

分类号：R512.32(传染病)

资助基金：公益性行业农业科研专项201203082

在线出版日期：2012-06-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：338-342