维氏气单胞菌吉林分离株外膜蛋白AⅡ基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

目的 克隆维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,AV)吉林株外膜蛋白AⅡ(OMPAⅡ)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.方法 根据维氏气单胞菌已知OMPAⅡ基因序列设计合成一对引物,通过PCR技术扩增OMPAⅡ基因,并将其克隆到pMD18-T载体上,阳性重组质粒经PCR鉴定后进行序列测定,通过BlastN分析维氏气单胞菌OMPAⅡ基因序列与其他菌种OMPAⅡ序列同源性,并构建系统进化树,同时对维氏气单胞菌OMPAⅡ蛋白进行生物信息学分析.结果 克隆基因长1 001 bp,与GenBank报道的基因序列同源性为95％,生物信息学软件分析OMPAⅡ蛋白无跨膜区,其N端含有1个信号肽,二级结构以β折叠和β转角为主,有10个区域可能存在B细胞抗原表位.结论 成功的克隆维氏气单胞菌OMPAⅡ基因,并对OMPAⅡ蛋白的相关生物信息学进行了分析.

关键词：维氏气单胞菌、外膜蛋白AⅡ、克隆、序列分析、生物信息学

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分类号：R917.1(药物基础科学)

资助基金：国家支撑计划项目2010BAD04B01;吉林省科技厅项目20080218;吉林农业大学青年启动基金项目联合资助;单晓枫和吴同垒为同等贡献

在线出版日期：2012-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1082-1085