人博卡病毒全基因组序列测定与种系分析

摘要：

目的 了解福州地区人博卡病毒(HBoV)在儿童呼吸道感染中的检出情况,并对其进行全基因组序列测定和种系分析.方法 收集2007年11月至2008年10月在福建省妇幼保健院因下呼吸道感染住院的重症监护病房的57例小儿鼻咽抽取物标本,用一对特异引物通过PCR扩增法对HBoV基因片段进行检测,对检测出的2例HBoV(FZ1和FZ40)用7对全序列引物进行扩增和拼接,获得这两株病毒全基因组序列,上传GenBank并与基因库中国内外其它10株HBoV的全基因组序列和各氨基酸序列进行比对,并做种系分析.结果 FZ1株基因组序列全长为5 299bp,与HBoV参考株st2株序列长度相同;而FZ40株的基因组序列全长少2bp.病毒全基因组编码4种蛋白,分别是非结构蛋白NS1、核蛋白NP-1和衣壳蛋白VP1、VP2.结论 种系分析显示福州的FZ40株与浙江温岭的WLL-1株关系较近,而FZ1株与北京的两株及泰国的CU6株关系较近.

关键词：人博卡病毒、全基因组、序列测定、种系分析

所属期刊栏目：26

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：建省自然科学基金2008J0177

在线出版日期：2010-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：158-162