2006年人禽流感H5N1毒株PA基因特性、变异和进化

摘要：

目的 通过对人禽流感H5N1毒株PA基因序列的变异分析,揭示毒株PA基因特征、变异与进化.方法 检测广东地区人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PA基因序列,采用MEGA 4.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析.结果 PA蛋白呈酸性,等电点pH 5.4.1997-2006年52株毒株PA基因核苷酸序列同源性分成两组,1997年毒株为第一组(G1),2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆毒株、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(G2).PA基因114个氨基酸位点置换,占15.9%(114/716),其中2003-2006年毒株PA基因有17个氨基酸位点不同于1997年毒株.PA基因Ks值为30.9×10-6～46.1×10-6 Nt/d,Ka值为4.50×10-6～8.13×10-6 Nt/d;而PA基因的同义突变速度是错义突变速度的5.7～6.9倍,显示PA基因受到机体免疫压力较小;检验发现PA基因进化存在负选择性压力.PA基因中潜在的7个糖基化位点基本稳定,毒株IDNS-569H-06的PA基因半胱氨酸发生置换(S224C).结论 PA基因进化分成两系列,PA基因进化特点是自发突变较快,而受到机体免疫机制压力较小;A基因与其它多聚酶基因(PB2和PB1)比较,核苷酸序列同源性和进化在时间特征和地区特征方面具有一致性;来自中国大陆的毒株进化值得关注.人禽流感H5N1毒株PA基因在自然界变异频繁,可能影响H5N1毒株致病性和在人-人传播能力.

关键词：人禽流感、H5N1毒株、PA基因、变异、进化

所属期刊栏目：24

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：东省科技项目2004A2090102

在线出版日期：2009-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1103-1106