日本血吸虫组织蛋白酶B肽链内切酶基因的获得及结构与功能分析

摘要：

目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)中国大陆株(chinese mainland strain)成虫cDNA文库中获得日本血吸虫新基因-组织蛋白酶B内切酶基因(Cathepsin B endopeptidase),利用生物信息学技术对其结构和功能进行分析和预测. 方法从已构建好的日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录;使用NCBI,SAPS,TMHMM,Signal,Psort II,Protscale和Scanprosite等软件对新基因的结构和功能进行分析和预测.结果对382个阳性克隆进行测序,获得部分新基因,其中包括组织蛋白酶B内切酶基因(AY226984).利用Internet在线分析和相关生物信息学软件对新基因的结构和功能进行了分析和预测.结论日本血吸虫组织蛋白酶B内切酶基因所编码蛋白为一跨膜蛋白,含有半胱胺酸蛋白酶结构域,可能对宿主血红蛋白具有降解作用,从而在日本血吸虫生长、发育过程中发挥作用.

关键词：日本血吸虫、cDNA文库、克隆、步移法、生物信息学、组织蛋 白酶B肽链内切酶

所属期刊栏目：20

分类号：R383.2(医学寄生虫学)

资助基金：湖南省卫生厅科研项目2001-Z05;湖南省教育厅科研项目

在线出版日期：2004-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：790-793