钩体LPS生物合成与装配途径及相关基因分析

摘要：

目的预测问号钩体黄疸出血型赖株脂多糖(LPS)合成、装配途径,并对其中几个关键基因的特征进行深入分析.方法使用NCBI/BlastX,ProDom/Blast,Jpred2,TMHMM对问号钩体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因所编码蛋白进行在线分析,并使用Bioedit,Pep Tool软件进行蛋白质一、二级结构分析.结果确定了脂质A和核心多糖生物合成基因lpxA、lpxB、lpxC、lpxD、lpxK、kdsA、kdsB、kdtA、lnt、htrB和O-抗原生物合成基因簇rfb locus 等以及装配、跨膜转运中的基因rfbP、rfbX、rfc、rfaL、rfe绘制了LPS合成及装配途径示意图.并对合成和装配途径中几个关键的基因编码蛋白(LpxA、 Rfc、 RfbX、 RfaL)的二级结构、跨膜区域、结构域等进行了分析.结论问号钩体黄疸出血型赖株LPS合成、装配途径与典型的革兰阴性菌,如大肠埃希菌K-12相似,主要差异在于钩体特殊的脂肪酸代谢途径和O-抗原多糖结构.该研究为进一步探讨钩体LPS基因功能及其与致病性关系奠定基础.

关键词：问号钩体、LPS、生物合成、生物信息学

所属期刊栏目：20

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2001AA223031

在线出版日期：2004-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：5-9,4