10.3969/j.issn.1001-2230.2016.02.002
肠膜明串珠菌及其近缘种dnaA和rpoB基因的系统发育分析
比较16S rRNA基因、dnaA、rpoB部分基因序列对Leuconostoc mesenteroides(Leu.mesenteroides)及其近缘种的分辨力,为肠膜明串珠菌提供快速准确的鉴定方法.以分离自自然发酵乳制品中的8株Leu.mesenteroides为研究对象,以其看家基因dnaA、rpoB部分基因序列作为分子标记,结合GeneBank数据库中的近缘种及亚种的相应序列构建系统发育树,并与16S rRNA基因的系统发育树进行比较.研究发现,基于Leu.mesenteroides及其近缘种的dnaA和rpoB部分基因序列构建的系统发育树的拓扑结构与16S rRNA基因基本一致,但分辨率高于16S rRNA基因;种间的dnaA和rpoB部分基因序列相似性分别为81.7~84.8%和85.5、87.4%,而种间16S rRNA基因相似性为98.1% ~99.5%.相较于16S rRNA基因,dnaA和rpoB基因更容易鉴定肠膜明串珠菌及其近缘种,其中rpoB可明晰区分试验菌株与肠膜明串珠菌亚种间的系统发育关系,因此rpoB基因可作为16S rRNA基因的辅助工具用于Leu.mesenteroides及其近缘种的快速鉴定.
肠膜明串珠菌、系统发育分析、16S rRNA基因、dnaA、rpoB
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Q93-33(微生物学)
国家自然科学基金项目31430066;国家高技术研究发展计划2011AA100901
2016-04-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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