云南省保山市2022年手足口病病例柯萨奇病毒A16型基因特征

摘要：

目的 分析云南省保山市2022年手足口病(hand,foot and mouth disease)病原监测结果,并对主要流行株柯萨奇病毒A16型(coxsackievirus A16,CVA16)基因特征进行分析,为手足口病防控提供科学依据.方法 对2022年云南省保山市送到云南省手足口病实验室的标本进行处理,提取病毒核酸,用引物(MD91/OL68-1)扩增肠道病毒(Entero-virus,EV)VP4/VP2结合区基因并测序,序列在GenBank进行BLAST搜索确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增VP1区全序并测序,使用肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping Tool Version 1.0)进行病毒型别鉴定.按参考文献下载肠道病毒标准序列,制作进化树,进行基因特征分析,对检测结果进行统计学分析.结果 本研究对保山市2022年手足口病临床诊断标本307例进行检测,实验室确诊280例,检出率91.21％(280/307),其中CVA16为55.05％(169/307),肠道病毒71 型(Enterovirus A71,EV-A71)为3.58％(11/307),其他肠道病毒为 32.57％(100/307).对送检的206份手足口病例标本,扩增肠道病毒VP4/VP2结合区和VP1区基因测序和鉴定,获得29株肠道病毒,肠道病毒阳性率为14.08％(29/206),均为A组病毒,未检测到B、C、D组病毒.送检病毒株分为3个血清型,其中CVA16有27株,占93.10％(27/29);EV-A71 有 1 株,占 3.45％(1/29);柯萨奇病毒 A10型(coxsackievirus A10,CVA10)有 1 株,占 3.45％(1/29).保山市2022年手足口病病例CVA16型基因的VP4/VP2结合区、VP1区检测阳性率为13.11％(27/206),基因进化分析表明27株CVA16为B1a亚型,并可分为2个进化分支.结论 2022年云南省保山市手足口病主要流行毒株为CVA16基因型,属于B1a亚型,该亚型又可分为2个分支,2022年保山市存在2个传播链流行.今后应加强监测,提高监测质量,掌握病毒流行特征.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒A组16型、基因特征分析

所属期刊栏目：23

分类号：R373.2+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2023-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1104-1108