深圳市龙华区2019年札如病毒基因分型以及进化分析

摘要：

目的 分析2019年深圳市龙华区札如病毒的基因型别,掌握辖区内札如病毒的流行情况.方法 采用实时荧光定量PCR对283份龙华区感染性腹泻疫情样本进行轮状病毒、诺如病毒和札如病毒核酸检测,对札如病毒阳性样本核酸采用RT-PCR(反转录-聚合酶链式反应)扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传进化分析.结果 2019年龙华区共发生感染性腹泻聚集性疫情24起,共采集283份样本.其中由诺如病毒引起15起(占62.5％),札如病毒引起4起(占16.6％),札如和诺如病毒共同引起1起(占4.1％),未检测出病原体4起(占16.6％).283份感染性腹泻疫情样本中,诺如病毒检测阳性率为17.7％(50/283);札如病毒阳性率为8.1％(23/283),轮状病毒未检出,所有病例无混合感染情况.23例札如阳性样本有5例VP1条带扩增成功,扩增效率为21.7％,基因亚型鉴定分析结果表明2株为GⅡ.3型,3株为GⅡ.4型.结论 在2019年龙华区腹泻疫情方面,GⅡ.3和GⅡ.4型是札如病毒的主要型别.诺如依然是龙华区感染性腹泻中引起散发和暴发的首要病原体,星状,轮状,腺状仅在散发病例中发现,而札如已成为引起急性腹泻病的重要病原体,应尽快开展龙华区对札如病毒的常规检测和进一步的分子分型工作.

关键词：札如病毒、进化分析、基因分型、疫情暴发

所属期刊栏目：21

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：深圳市三名工程项目;深圳市龙华区科创项目

在线出版日期：2021-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：247-250