广东省东莞市2017—2018年登革病毒E基因进化分析

摘要：

目的 测定广东省东莞市2017—2018年Ⅰ～Ⅳ型登革病毒(DENV-1～DENV-4)的E基因序列,分析其系统进化情况及流行基因亚型,从分子水平探讨病毒来源.方法 收集东莞市2017—2018年140例可疑登革热患者急性期血清,用实时荧光PCR方法 检测病毒核酸,阳性血清用C6/36细胞分离培养登革病毒,测定分离株E基因序列,绘制系统进化树,结合流行病学资料进行分子流行病学分析.结果 140份急性期血清中DENV核酸阳性54份,阳性率38.6％,DENV-1阳性占53.7％.分离得到17株毒株.序列比对和系统进化分析显示,10株DENV-1分离株间核苷酸同源性为90.0％～99.9％,氨基酸同源性为96.6％～99.8％,分属基因Ⅰ型和基因Ⅴ型.7株基因Ⅰ型分离株与泰国2015年、缅甸2015年、中山2015年及越南2016年流行株核苷酸同源性较高(99.3％～99.9％),其中2018年本地株D2018078与2017年输入株D2017008核苷酸同源性达99.8％;3株基因Ⅴ型分离株与印度2014年、2017年株及新加坡2014年流行株核苷酸同源性较高(97.7％～99.1％).4株DENV-2分离株间核苷酸同源性为91.0％～98.6％,推导氨基酸同源性为97.6％～99.8％,分属混合型和亚洲Ⅰ型,2株混合型分离株与马来西亚2014年、台湾2015年流行株核苷酸同源性较高(99.6％～99.7％);2株亚洲Ⅰ型分离株分别与越南2015年、泰国2011年流行株核苷酸同源性较高(99.3％～99.5％).2株DENV-3分离株间核苷酸同源性为98.4％,氨基酸同源性为99.4％,均属基因Ⅰ型,与缅甸2017年、马来西亚2015年流行株核苷酸同源性较高(99.3％～99.7％).1株DENV-4分离株与越南2013、2016年流行株同源性较高(99.3％～99.5％),属基因Ⅰ型.结论 2017—2018年东莞市登革热的病原体主要为DENV-1,其次是DENV-2,各至少有2种基因亚型同时在流行;DENV-3和DENV-4各至少有1种基因亚型在流行.流行方式主要为南亚和东南亚国家及我国中山、台湾等地输入病例引起的本地暴发流行,存在输入引起本地感染的风险.

关键词：Ⅰ~Ⅳ型登革病毒(DENV-1~DENV-4)、E基因、基因亚型、序列同源性、进化分析

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分类号：R373.3+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：东莞市社会科技发展一般项目No.20165075001617

在线出版日期：2020-08-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：963-971