新型甲型H1N1流感病毒深圳分离株HA基因的克隆与进化

摘要：

目的 分析2009年新型甲型H1N1流感病毒深圳分离株A/Shenzhen/71/09血凝素(Hemagglufinin,HA)基因序列,探讨其基因变异与分子进化.方法 采用RT-PCR技术扩增A/Shenzhen/71/09 HA基因片段并进行测序,利用Cluster和Mega3.1软件对不同亚型毒株HA基因核苷酸序列进行分析,绘制发育进化树. 结果 A/Shenzhen/71/09毒株HA基因包含HA1和HA2两个片段,长度分别约为1 032bp和669bp,HA蛋白裂解位点为VPSIQSR↓ GLF,不含连续碱性氨基酸.进化分析表明该病毒株与其它亚型病毒株遗传距离较远,而与深圳地区同期分离的其它H1N1毒株高度同源,同源性在99.0％以上.结论 新型甲型H1N1流感病毒HA基因不具备高致病流感病毒序列特征,深圳地区同期分离的毒株变异率低,但仍需密切关注新型甲型流感的传播情况.

关键词：甲型H1N1流感病毒、血凝素、进化分析

所属期刊栏目：12

分类号：R511.7(传染病)

资助基金：东莞市科技计划项目200910815229;深圳市科技计划项目201002107

在线出版日期：2013-01-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：916-918