一种用于芯片质控的通用序列标签寡核苷酸探针的设计

摘要：

目的 设计一种带有通用序列标签的寡核苷酸探针以应用于寡核苷酸芯片点样的质量控制.方法 以HIV寡核苷酸探针作为核心序列,在其一端或两端连接上多种通用序列标签(UST)构建新型探针.然后打印芯片,以Cy5标记的通用引物(Cy5-UP,与UST互补)进行杂交,筛选出5条荧光信号强的探针,重新打印芯片.再分别以不同浓度梯度的、Cy5标记的通用引(Cy5-UP)和随机引(Cy5-RP)与芯片杂交,比较两者杂交效率.结果 Cy5-Up的杂交结果显著优于Cy5-RP的杂交结果,特别是在较低浓度时.结论 利用Cy5标记的通用引物检测探针上的通用序列标签,可以为芯片点样的质量控制提供一种更有效的方法.

关键词：寡核苷酸芯片、质量控制、探针设计

所属期刊栏目：11

分类号：R318(医用一般科学)

资助基金：广东省医学科研基金B2005076;广州市科技计划项目2007Z3-E0521

在线出版日期：2011-03-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：39-42