ATP结合盒转运蛋白A5在胰腺癌中的预后意义的生物信息学分析与验证

摘要：

背景与目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白家族的成员ABCA5在多种肿瘤中发挥着重要的作用.然而,ABCA5在胰腺癌中的研究尚不清楚.因此,本研究通过生物信息学分析及临床样本验证,探讨ABCA5在胰腺癌中的表达及与患者预后的关系,同时对ABCA5在胰腺癌中的可能作用机制进行分析.方法:使用TCGA和GEO数据库,分析ABCA5在胰腺癌组织及正常组织中的表达情况,并用Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,Cox比例风险模型进行单因素与多因素分析.采用免疫组织化学法检测65例胰腺癌组织和癌旁组织中ABCA5 的表达,并分析其与预后及胰腺癌临床病理特征的关系.使用TIMER、STRING和Gene MANIA数据库对ABCA5与免疫细胞浸润、蛋白互相作用网络(PPI)和基因-基因互作网络进行分析.利用基因富集分析(GSEA)和相关性分析对ABCA5在胰腺癌中可能参与的信号通路及其可能的作用机制进行探索.通过癌症药物敏感性基因组学(GDSC)分析ABCA5与治疗药物敏感性的关系.结果:在TCGA和GEO数据集中,ABCA5在胰腺癌组织中的表达明显低于正常组织(均P<0.05).在TCGA和GSE62452数据集中,ABCA5低表达的患者生存时间明显缩短(均P<0.05);ABCA5的表达是胰腺癌患者预后的独立影响因素(HR=0.458,P=0.001;HR=0.439,P=0.017).65例临床病例分析显示,ABCA5在癌组织与癌旁组织相比处于低表达水平,且ABCA5低表达患者的预后更差(均P<0.05),单因素与多因素Cox回归分析表明ABCA5 的表达是胰腺癌患者预后的独立影响因素(HR=0.327,P= 0.032).TIMER数据库结果显示,ABCA5表达与免疫浸润密切相关.PPI蛋白互作网络显示,有14个与ABCA5相关的互作蛋白;基因-基因互作关系网络图得到20个与ABCA5相关的互作基因.基因富集分析与相关性分析结果显示,ABCA5 在胰腺癌中可能与细胞周期和铁死亡有关.ABCA5 高表达患者对5种治疗药物的IC50明显低于ABCA5低表达患者(均P<0.05).结论:ABCA5在胰腺癌组织中低表达并与患者不良预后相关,其表达水平是胰腺癌患者预后的独立影响因素,ABCA5在胰腺癌中的作用机制可能与细胞周期、免疫调节和铁死亡有关.

关键词：胰腺肿瘤、预后、ATP结合盒转运蛋白A5、计算生物学、铁死亡

所属期刊栏目：32

分类号：R735.9(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;江苏省连云港市卫生计生科技基金资助项目;江苏省连云港市卫生计生科技基金资助项目;江苏省连云港市科技局科技计划基金资助项目;江苏省连云港市第一人民医院科研基金资助项目;江苏省连云港市第一人民医院科研基金资助项目

在线出版日期：2023-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1313-1323