腹主动脉瘤特异性ceRNA调控网络的筛选与构建

摘要：

背景与目的:腹主动脉瘤(AAA)是一种在老年患者中发病率及病死率均较高的疾病.目前基于内源性竞争RNA(ceRNA)网络在AAA发病机制中的作用不明.本研究通过筛选和构建AAA特异性的长链非编码RNA(IncRNA)-微小RNA(miRNA)-mRNA的ceRNA网络,以期揭示ceRNA网络在AAA形成与发展中的作用.方法:首先通过基因表达数据库(GEO)筛选数据集,寻找AAA与正常腹主动脉组织的差异lncRNA及差异mRNA;利用Lasso回归从差异RNA中筛选疾病特征性基因;运用软件Starbase寻找与差异lncRNA和特异性mRNA共同结合的miRNA,利用Cytoscape软件构建lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络,使用Cytoscape中的cytohubba模块进一步筛选核心ceRNA网络.结果:筛选获得GSE7084和GSE57691两个数据集,获得差异mRNA 114个,差异lncRNA 13个;利用Lasso回归从差异mRNA中获得17个特异性的mRNA;结果显示,lncRNA HCP5-miR27-FOSB被认为可能是导致AAA发生发展最为关键的ceRNA网络.结论:所构建的ceRNA网络可能参与AAA的形成及发展,但该结果需开展后续研究进一步探明和验证.

关键词：主动脉瘤、腹、RNA、未翻译、计算生物学

所属期刊栏目：31

分类号：R654.3(外科学各论)

在线出版日期：2023-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1653-1659