富亮氨酸α2糖蛋白1在乳腺癌中的表达及其功能的生物信息学分析

摘要：

背景与目的:富亮氨酸α2糖蛋白1(LRG1)是富亮氨酸重复序列(LRR)家族蛋白成员,近些年研究显示LRG1在恶性肿瘤的发生、上皮间质转化、侵袭转移、异常血管生成、预后预测中发挥重要作用.然而LRG1在乳腺癌中的表达、预后、功能和潜在机制方面尚待阐明.本研究旨在通过生物信息学方法系统分析LRG1在乳腺癌中的表达及意义.方法:使用 TCGA、Breast Cancer Gene-Expression Miner、UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、GeneMANIA、DAVID等多个数据库对LRG1在乳腺癌中的表达与临床病理特征关系、预后价值、相互蛋白作用网络及功能富集进行综合分析.结果:TCGA数据库分析显示,LRG1 mRNA在乳腺浸润癌中的表达量明显高于正常组织(23.461 vs.8.357,P＜0.001).在不同分子亚型中,luminal型乳腺癌中 LRG1 mRNA表达量为 37.462(9.930～74.197),高于HER-2阳性型乳腺癌和三阴性乳腺癌(TNBC)(均P＜0.01);Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期乳腺癌中LRG1 mRNA的表达水平均高于正常乳腺组织(均P＜0.05).Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析显示,雌激素受体(ER)和(或)孕激素受体(PR)阳性乳腺癌中LRG1 mRNA的表达水平高于ER和(或)PR阴性乳腺癌,HER-2阴性乳腺癌中LRG1 mRNA表达高于HER-2阳性型乳腺癌(均P＜0.05);淋巴结阳性乳腺癌LRG1 mRNA表达量高于淋巴结阴性乳腺癌(P＜0.000 1).用GEPIA在线平台对TCGA数据库中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1高表达患者总生存率(OS)及无复发生存率(RFS)均低于低表达患者,但差异无统计学意义(HR=0.81,P=0.200;HR=0.70,P=0.064);用 Kaplan-Meier plotter 对TCGA中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1的表达与luminal A型、luminal B型、HER-2阳性型乳腺癌的OS无明显关系(均P＞0.05),但在basal-like亚型中,LRG1低表达患者OS明显优于LRG1高表达患者(HR=3.12,95％CI=1.54～6.29,P＜0.001).使用 GeneMANIA数据库进行分析,共筛选出 20个与 LRG1相互作用蛋白质,GO富集分析显示,LRG1及与其共表达相关的20个蛋白富集于细胞胞外区,外泌体,血液微粒,受体复合物等结构中,参与细胞的血管生成调控、上皮间充质的转化、缺氧反应等相关生物学过程.结论:LRG1在乳腺癌组织中表达上调,并可预测部分不良乳腺癌亚型的预后,LRG1可能为乳腺癌治疗提供新的靶点.

关键词：乳腺肿瘤、富亮氨酸α2糖蛋白1、预后、计算生物学

所属期刊栏目：31

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：河北省医学科学研究重点计划基金资助项目20211400

在线出版日期：2022-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：640-647