长链非编码RNA 909靶向调控miR-194-5p/DACH1轴对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响

摘要：

背景与目的:长链非编码RNA 909(LINC00909)是一个新发现的长度约为2 kb的长链非编码RNA(lncRNA),在胶质瘤和白血病中被报道发挥癌基因的作用.然而LINC00909在胰腺癌中的作用鲜有报道.本研究旨探讨LINC00909在胰腺癌中的表达及其对患者预后的影响,以及LINC00909与其调控网络对胰腺癌细胞生物学行为的影响.方法:通过Ualcan在线分析LINC00909在TCGA数据库中24种肿瘤组织中的表达情况.通过LinkedOmics在线分析LINC00909在176例胰腺癌中的表达及预后情况.利用lncRNA-miRNA结合数据库(starBase)及3个 miRNA-mRNA 结合数据库(miRmap、miRanda 和 TargetScan),预测 LINC00909的 靶 microRNA(miRNA)以及靶miRNA下游的mRNA,并构建LINC00909-miRNA-mRNA网络.用R语言"limma"包对癌旁和癌组织的miRNA进行表达差异对比分析.利用R语言"survival"包、"survminer"包及"ggstat-splot"包,对所得到的基因进行生存分析及相关性分析.在胰腺癌PANC-1细胞上,用敲减实验(转染LINC00909 siRNA)分析LINC00909对PANC-1细胞增殖、迁移及侵袭的影响;用回复实验(同时转染LINC00909 siRNA与靶miRNA抑制剂)及验证LINC00909与靶miRNA之间的靶向关系.用双荧光素酶报告基因实验验证靶miRNA与LINC00909以及下游mRNA之间的互作关系.结果:Ualcan分析表明LINC00909在胰腺癌组织中低表达.LinkedOmics分析表明LINC00909低表达患者的预后差(P<0.05).通过starBase数据库获得28个与LINC00909结合的miRNA,进一步通过对TCGA胰腺癌miRNA表达数据分析发现,只有miR-194-5p在胰腺癌中表达明显上调.通过miRmap、miRanda和TargetScan数据库获得114个与miR-194-5p结合的潜在mRNA.进一步对114个mRNA进行表达相关性分析及生存分析,获得4个 mRNA(DACH1、SOCS2、STX16及 SNAP91),最终获得 LINC00909-miR-194-5p-DACH1/SOCS2/STX16/SNAP91的ceRNA网络.敲减实验显示,LINC00909低表达组PANC-1细胞的增殖活力增加、划痕愈合率、迁移与侵袭细胞数均较对照组明显升高(均P<0.05).回复实验表明,回复组DACH1 mRNA的表达水平升高,且细胞的增殖活力、划痕愈合率、迁移与侵袭细胞数均较LINC00909低表达组明显降低(均P<0.05).双荧光素酶报告基因实验表明,miR-194-5p模拟物能够抑制含有其结合位点的LINC00909和DACH1质粒的荧光素酶活性(均P<0.05).结论:LINC00909在胰腺癌组织中低表达且发挥抑癌作用,其可能通过靶向调控miR-194-5p/DACH1轴来抑制PANC-1细胞的增殖、迁移及侵袭能力.

关键词：胰腺肿瘤、RNA、长链非编码、微RNAs、细胞增殖、肿瘤浸润

所属期刊栏目：31

分类号：R735.9(肿瘤学)

资助基金：西南医科大学校级基金资助项目2018-ZRQN-077

在线出版日期：2022-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：340-350