甲状腺癌中m6A甲基化调控因子的表达及其预后价值

摘要：

背景与目的:甲状腺癌发病率逐年升高,但其发病机制仍不清楚,阐述甲状腺癌的发病机制对改善甲状腺癌患者的预后至关重要.研究表明,m6A甲基化调控因子高度参与癌症发生发展,具有良好的潜在预后价值.因此,本研究通过生物信息学方法分析甲状腺癌中m6A甲基化调控因子的表达并构建基于m6A甲基化调控因子的甲状腺癌预后模型.方法:从TCGA数据库下载甲状腺癌m6A甲基化调控因子的表达数据和相应的临床病理资料,通过Wilcoxon检验分析20个m6A甲基化调控因子在肿瘤和正常组织的差异表达;用一致性聚类分析将甲状腺癌患者分为两个聚类,比较两个聚类患者临床病理因素和总体生存率的差异;Lasso Cox回归分析构建风险预测模型并用ROC曲线下面积(AUC)评估模型的预测能力.结果:19个m6A甲基化调控因子在甲状腺癌和正常组织表达具有统计学差异(均P＜0.05),其中HNRNPC、IGF2BP2、FMRl在甲状腺癌组织中明显高表达,而其余表达下调.聚类分析示,cluster 1生存期低于cluster 2(P＜0.05),颈淋巴结转移发生率明显高于cluster 2(P＜0.01) 基于Lasso Cox回归分析筛选的4个基因(IGF2BP2、RBM15、YTHDF1、YTHDF3)构建风险评估模型,相比低风险组患者,高风险患者生存期明显缩短(P=0.007);ROC曲线示,该模型可以预测甲状腺癌患者的预后(AUC=0.731).结论:m6A甲基化调控因子在甲状腺癌中存在差异表达,基于甲状腺癌中关键m6A甲基化调控因子所构建的预后风险模型具有较好的预测能力,可为临床决策提供一定的依据.

关键词：甲状腺肿瘤;RNA甲基化调控因子;预后;计算生物学

所属期刊栏目：30

分类号：R736.1(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目;湖南省自然科学基金资助项目;中南大学研究生创新型课题基金资助项目

在线出版日期：2021-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：934-941