蛋白质组学技术分析肝癌细胞HCCLM3的细胞外蛋白降解组

摘要：

目的:分析肝癌细胞系HCCLM3的细胞外蛋白降解组,筛选肝癌标记物.方法:凝胶电泳分离HCCLM3细胞外蛋白,线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱(LTQ-FT-MS/MS)对其鉴定,数据库检索结合分子质量分析其降解组.免疫杂交定量骨桥蛋白( OPN)在正常、乙肝、乙肝肝硬化和肝癌4组血清中的表达.结果:HCCLM3细胞外蛋白电泳共测得51个条带,鉴定出1405种非冗余蛋白,其中474种蛋白发生降解,且分泌蛋白的降解率最高(50％).肝癌患者血清中OPN 20 kD片段明显高于其余3组(P＜0.05),受试者工作特征曲线(ROC)显示AFP对肝癌诊断的曲线下面积(AUC)为0.79,OPN 20 kD片段的AUC为0.68,两者结合后能提高AUC至0.89.结论:凝胶电泳结合质谱技术研究肝癌蛋白降解组有效可行,骨桥蛋白20 kD片段可能对肝癌的诊断具有价值.

关键词：癌、肝细胞、骨桥蛋白、蛋白质组学、降解组

所属期刊栏目：21

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：广东省自然科学基金资助项目9151008901000186

在线出版日期：2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：807-810