基于RNA-Seq技术的干酪基质下红曲霉生长转录组初步信息分析

摘要：

采用转录组测序(RNA-Seq)技术,对生长在干酪基质环境下的红曲霉(Monascus)进行了转录组分析.采用第二代测序技术,基于Illumina NextSeq 500测序平台进行分析,得到了序列总长度为59 935 140 bp的转录本(transcripts),22 377 414 bp长度的非重复序列基因(unigene),共18 042条.对聚类得到的Unigene与数据库NR、GO、KEGG、eggNOG和Swiss-Prot进行比对并作基因功能注释,注释到GO数据库的序列有12 186条,注释到eggNOG数据库的序列有17 777条,KEGG中有3 251条序列被注释到,涉及的pathway有42条.这些注释信息的完成在基因组学上为红曲霉应用于干酪的生产提供了重要依据.

关键词：红曲霉、干酪、转录组、RNA-Seq技术、基因注释

所属期刊栏目：36

分类号：TS261.1(食品工业)

资助基金：上海市科委工程技术研究中心能力提升项目16DZ2280600;国家“十二五”科技支撑计划课题2013BAD18B02

在线出版日期：2018-01-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：118-121