桃小食心虫鱼尼丁受体基因克隆及表达模式分析
【目的】二酰胺类杀虫剂的作用靶标鱼尼丁受体（ryanodine receptor, RyR）是目前所知的最大的离子通道蛋白，该受体可控制细胞内Ca2+的释放，对细胞内Ca2+的稳定起着关键作用。克隆获得桃小食心虫鱼尼丁受体基因（CsRyR）全长序列，进一步解析该基因在桃小食心虫(Carposinasasakii)各发育阶段的表达模式。【方法】通过同源序列比对的方法，利用cDNA末端快速扩增技术（RACE）获得该基因的全长cDNA序列；应用生物信息学软件对该基因的开放阅读框、编码的氨基酸序列、功能结构域等信息进行预测分析，并基于最大似然法构建该基因与其他昆虫相关基因序列的系统发育树，明确其系统进化关系。分别提取桃小食心虫各发育阶段RNA，以GAPDH为内参基因，应用RT-qPCR技术，解析CsRyR在桃小食心虫各发育阶段（卵、幼虫、蛹和成虫）的表达模式。【结果】桃小食心虫CsRyR的cDNA全序列长度为15766 bp，开放阅读框15405 bp，编码5134个氨基酸。氨基酸序列比对结果显示，CsRyR与脊椎动物RyRs的一致度分别为45%—47%；与秀丽隐杆线虫（Caenorhabditiselegans）RyR的一致度也为46%。在昆虫RyRs中，与鳞翅目一致度为91%—94%，与同翅目、双翅目昆虫一致度均为79%。系统发育树显示该基因编码的蛋白质与鳞翅目夜蛾科和螟蛾科害虫RyRs亲缘关系最近。结构域分析结果显示，CsRyR具有RyR的典型结构域，如位于C-末端的6个跨膜结构域（AA 4467-5029）、释放Ca2+的通道形成基序GVRAGGGIGD、Ca2+结合位点EF-hand和3个ATP结合位点GXGXXG等。二酰胺类杀虫剂可能的作用位点AA 183-290（BmRyR），AA 4610-4655（DmRyR）和4946G（PxRyR）在CsRyR中无特殊性。此外，CsRyR中存在AA 2490-2496 TQAPRPG和5131-5134 SQAK两个基序，在其他物种中均没有发现。RT-qPCR分析结果表明，CsRyR在蛹期表达量最高，分别是1日龄卵、6日龄卵、初孵幼虫、老熟幼虫和成虫的25.19、7.73、6.48、4.74和3.58倍。【结论】克隆了CsRyR基因全长cDNA序列，证明其表达具有发育阶段特异性。
桃小食心虫、鱼尼丁受体、基因克隆、发育阶段、表达模式
Q785;S917.4;R377.5
中央级基本科研业务费预算增量项目;植物病虫害生物学国家重点实验室开放基金;辽宁省博士启动基金
2015-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
1971-1981
