苎麻自交纯合进度研究

摘要：

目的研究苎麻自交后代群体的遗传多样性和群体结构，探究自交纯合进度，对自交后代群体的纯合趋势进行判断。方法以中苎1号为材料，采用筛选出的多态性高的31对SSR引物和48对SRAP引物对3个自交后代群体的基因组DNA进行扩增。通过DNA位点纯合率和遗传多样性参数分析群体的遗传多样性。用Structure、NTSYS和AMOVA软件对群体结构进行分析。并用标记指数来比较SSR和SRAP标记方法的标记效率。结果 SSR和SRAP标记得到的多样性指标变化明显，从S3代到S5代，平均扩增出57条和157条多态性条带，DNA位点纯合率上升了5.2%和4.61%，多态性位点减少了13个和44个，有效等位基因数降低了0.7883个和2.1629个，基因多样性下降了0.1143和0.0684，多样性指数降低了0.0465和0.1207。用Structure软件对群体结构分析表明S5代群体中蓝色组分最多，均在65%以上。主成分分析表明，S3群体的分散程度最高，S4和S5群体比较集中，而且S3群体包含了S4和S5群体的大部分。2种标记方法得到的群体结构和主成分分析表明，经过连续自交，后代群体的一致性越来越好。用AMOVA软件对群体内和群体间的分子变异情况分析表明2种标记方法都显示群体内变异（94.69%和99.02%）明显大于群体间变异（5.31%和0.98%），均达到整体变异的94%以上。SSR标记得到的位点平均信息量（H av=0.4689）高于SRAP的估计值（Hav=0.4197），而平均有效复合指数（EMR=3.2781）SRAP标记大于SSR标记（EMR=1.8562），标记效率值SRAP标记（MI=1.3758）大于SSR标记（MI=0.8704）。结论 SSR和SRAP两种分子标记适于苎麻资源的遗传多样性和群体结构分析。随着自交代数的增多，后代群体的一致性不断提高，杂合度逐渐降低。

关键词：苎麻、SSR、SRAP、遗传多样性、群体结构

分类号：TQ6;S68

资助基金：国家科技支撑计划2010BAD02B01

在线出版日期：2014-12-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：4371-4379