苹果属S-RNase基因的进化研究

摘要：

[目的]通过分析苹果属植物自交不亲合性位点S-RNase基因的序列,研究S-RNase基因在苹果属的进化历史,序列分歧特点和遗传多态性.[方法]利用栽培苹果的S-RNase基因序列在GenBank数据库中检索和鉴定所有已知的苹果属植物的S-RNase基因,同时利用S-RNase基因的保守引物获得陇东海棠和变叶海棠的S-RNase基因序列.通过系统发育分析研究S-RNase基因的进化历史,进而计算dN/dS比值揭示S-RNase基因序列分歧的特点,最后估计并比较苹果属不同类群S-RNase基因的遗传多态性及其遗传分化.[结果]苹果属植物的S-RNase基因可以分为16个亚类,同一亚类S-RNase基因的序列分歧较小,亚类之间的分歧很大.S-RNase基因的成对dN/dS比值中有50％的大于1,并且滑动窗分析显示S-RNase基因具有多个dN/dS比值显著大于1的区域.栽培苹果和野生苹果在S-RNase基因的遗传多态性上没有明显差异.在所涉及的苹果属野生类群中,栽培苹果与塞威士苹果在S-RNase基因上的遗传分化最小.[结论]适应性氨基酸替换在苹果属植物S-RNase基因的序列分歧上发挥了重要作用.现有的S-RNase基因数据显示栽培驯化没有导致栽培苹果S-RNase基因遗传多态性的降低,基于S-RNase基因的遗传分化支持栽培苹果是由塞威士苹果驯化而来的观点.

关键词：苹果属、S-RNase基因、进化历史、序列分歧、遗传多态性

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资助基金：国家自然科学基金项目31071769;重庆市自然科学基金项目cstc2012jjA0725;西南大学科研基金项目XDJK2012C072

在线出版日期：2013-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：2717-2729