利用cDNA-AFLP分析内生解淀粉芽胞杆菌Fy11诱导辣椒差异表达基因

摘要：

[目的]分析内生解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)Fy11诱导辣椒(Capsicum annuum)幼苗差异表达基因,了解辣椒与内生芽胞杆菌互作的分子机制.[方法]利用cDNA-AFLP技术,采用256对引物,分析辣椒幼苗接种内生解淀粉芽胞杆菌Fy11后5个时间点的基因表达谱；利用qRT-PCR分析差异基因表达模式,验证cDNA-AFLP表达谱.[结果]256对引物共产生18620个转录本(TDF),筛选获得353条差异表达条带,占扩增条带总数的1.89％.经克隆、测序分析,最终获得257个差异TDF,聚类分析得到229个独立基因(EST,unigenes),其中144个基因上调表达,85个基因下调表达.经Blastx比对和功能分类分析,其中65条EST(28.38％)未找到同源性匹配,8条(3.49％)与未知功能蛋白同源性较高.其余156条EST主要涉及基础代谢基因(10.92％);与能量和抗病与防御类相关基因,各占8.73％；信号转导基因占7.42％；转运子或转座子基因占6.99％；与细胞结构相关基因占6.55％；参与转录调控基因占5.68％；细胞生长类基因占3.93％；参与蛋白质运输和储存有8个基因,占3.49％；蛋白质合成类基因占2.18％；次生代谢类和胞间运输类基因,其数量相对较少,各占1.75％.选取与抗病防御、转录调控及信号转导类等相关的10个差异基因,qRT-PCR分析结果显示其表达模式符合cDNA-AFLP表达谱.[结论]内生细菌与植物互作的分子机制涉及植物多方面生理生化反应,包括抗病防御、转录调控、蛋白质代谢、信号转导、以及非生物胁迫等多种途径相关基因的协同控制.

关键词：辣椒、内生解淀粉芽胞杆菌、互作、基因表达、cDNA-AFLP、qRT-PCR

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资助基金：国家自然科学基金项目30671463;福建省发改委项目KY0030060

在线出版日期：2013-10-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2449-2458