鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达谱与功能预测分析

摘要：

[目的]全面了解鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达情况和潜在生物学功能,为揭示下丘脑调控鸡机体能量平衡的分子机制奠定基础.[方法]采用茎-环定量RT-PCR方法检测miR-101在固始鸡4个发育阶段、1 3种组织中的表达,利用Pictar算法预测miR-101的靶基因并对预测靶基因分别进行Gene Ontology分析、通路分析和分层富集.[结果]miR-101的表达具有明显的时序特征和组织特异性,胚胎期各组织中的表达水平明显高于出壳后,脑部各组织中的表达水平明显高于其它被检测的组织,并在14胚龄下丘脑以及17胚龄小肠和腿肌中高丰度富集；miR-101的预测靶基因在生物学调节、代谢过程、发育过程和细胞过程等基本生物学过程中显著富集；针对神经系统发育的生物信息学分析显示,miR-101调控功能主要涉及脑发育、神经元分化、神经发生调节、神经胶质细胞分化和星形胶质细胞分化等生物学过程.[结论]miR-101为脑部组织高丰度表达miRNA,在脑发育相关的许多生物学过程中可能发挥重要的调节作用.

关键词：miR-101、组织表达谱、靶基因、GO富集分析、鸡

所属期刊栏目：46

资助基金：国家自然科学基金项目31072023

在线出版日期：2013-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1247-1255