大麦BAC文库三维混合池的构建与HvGW2筛选

摘要：

[目的]从大麦BAC文库中快速筛选包含目的基因HvGW2的阳性BAC克隆.[方法]构建BAC文库三维混合池,设计2对HvGW2特异性引物,进行BAC文库筛选,对含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆进行测序,获得编码大麦GW2蛋白的基因组DNA序列,并与禾本科中的GW2进行同源进化分析.[结果]构建了大麦BAC文库的三维混合池160个,文库空载率为0.18％;筛选到含HvGW2的阳性BAC克隆3个,其中,BAC克隆196M02包含完整编码该基因的序列;HvGW2包含8个外显子和7个内含子,具有与其它植物GW2相似的结构特征和保守的功能结构域;同源进化分析结果显示,大麦与小麦的GW2蛋白同源性最高;序列分析发现,HvGW2第6内含子上包含2个不同类型的反转录转座子插入,从而使大麦比其它作物的GW2长度增加11.5 kb以上.[结论]通过构建三维混合池快速筛选包含目的基因的单个阳性BAC克隆,建立了大麦目标基因克隆的辅助平台;HvGW2基因组中位于内含子区的反转录转座子插入导致基因长度增加,可能是影响该基因转录水平的关键变异.

关键词：大麦、BAC文库、三维混合池、HvGW2、粒重基因

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资助基金：国家“863”计划项目2012AA101105-4;国家“十二五”科技支撑计划2012BAD03B01-2;国家现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-05

在线出版日期：2013-12-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：9-17