黄瓜细胞质型谷氨酰胺合成酶基因(GS1)的克隆及其在低氮条件下的表达
[目的]分离和克隆黄瓜谷氨酰胺合成酶GS1基因,分析其序列特征,了解其在低氮条件下的表达情况.[方法]依据黄瓜基因组数据库中Csa015274基因编码区全序列,应用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物,从黄瓜叶片cDNA中克隆该基因,用生物信息学方法对获得的cDNA序列及推定氨基酸序列进行分析鉴定,并用实时荧光定量PCR法研究GS1基因在不同氮素浓度下的表达变化.[结果]分离到GS1基因,GenBank登录号为JQ277263.该基因长1071 bp,编码356个氨基酸,与甜瓜(Cucumis melo L.)GS1基因同源性高达97%.该基因编码的蛋白是1个不稳定的疏水蛋白,无跨膜结构,无信号肽,存在蛋白激酶C磷酸化位点,酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,N-十四酰化位点,酪氨酸激酶磷酸化位点等活性位点.GS1基因表达模式分析显示,在低氮条件下,该基因下调表达,随着氮素浓度的增高GS1基因的表达量增加.在高浓度的氮素水平下,该基因的表达同样受到抑制.[结论]成功从黄瓜叶片中分离克隆到GS1基因,该基因具有已知物种GS1基因的特征,可用于该基因的功能研究.
黄瓜、GS1基因、克隆、序列分析、低氮
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F3(农业经济)
国家自然科学基金;国家科技支撑计划
2012-12-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
3100-3107